◆ 采编部：
负责馆藏图书及非纸质文献的采购。并负责对上述文献进行验收、分类、编目和对现有目录进行管理，负责建设新书及回溯书目数据库。同时还承担采编中心工作，协助部分成员馆书目预订、现场选书及书目数据加工工作。
◆ 借阅部：
负责馆藏中外文图书的读者借阅工作。包括中文社会科学图书借阅室（1）、中文社会科学图书借阅室（2）、中文社会科学图书借阅室（3）、中文社会科学图书借阅室（4）、中文自然科学图书借阅室、中文保存本图书阅览室、吉林地方文献阅览室、外文图书借阅室、电子阅览室等对外服务窗口。承担集体借阅、图书流通站、学校及社区分馆的借还图书等工作；为读者提供检索、咨询等服务。
◆ 报刊部：
负责全馆中外文报刊的采购、验收、分类、典藏、书目数据加工及回溯建库工作，同时提供中外文报刊的阅览及借阅服务。现有中文期刊十九万余册，报纸八万余册，外文及港台报刊近一百种，光盘九千余盘，均按《中图法》第五版排架。
◆ 信息咨询部：
为党政机关立法决策、领导决策提供专题服务、舆情监测与参考、决策类信息产品等咨询服务；为企业的产品研发与技术创新提供科技查新、竞争情报、课题检索与专利信息服务；为高校及科研院所的知识创新提供论文引证检索、定题服务与文献提供服务。同时，免费为社会民众提供有关图书馆利用方面的知识服务与咨询服务；分别在吉林省图书馆网站开通“信息咨询服务站”，免费为民众提供基本参考咨询服务。
◆ 信息技术部：
负责保障馆域网络的安全和正常运行；各应用系统的正常运行；全馆计算机系统软硬件维护；门户网站的管理维护；数字图书馆体验区对外服务工作；吉林省图书馆APP及新媒体平台运维及管理工作；开展4d影院、高清数字电影放映业务；馆内多媒体设备设施的使用和管理工作；智慧图书馆项目建设工作，做好省内文化数字化工程发展的先锋，规划省内文化数字化发展方向，响应全国文化数字化发展要求。
◆ 历史文献部：
负责历史文献阅览室的读者服务；负责古籍善本文献、民国时期文献、旧日文图书的管理；负责历史文献开发和二次文献的编辑工作；负责吉林省的文献缩微和读者阅读工作；承担古历史文献的修复工作；负责全省古籍保护中心各项工作。
◆ 社会教育培训部：
面向全省开展各种类读者活动；举办各类讲座、展览；依据不同群体建立分馆；负责户外屏幕更新及维护。
◆ 学会（联盟）工作部：
负责全省图书馆学会工作、学术研究与指导、各系统图书馆间协作协调，开展学术交流与研讨，组织本省及省际间图书馆学会的学术交流与协作；负责全省市、县公共图书馆业务研究、辅导及培训，定期编发《吉图通讯》；负责图书馆联盟日常工作。
◆《图书馆学研究》编辑部：
负责完成《图书馆学研究》杂志的编辑、出版、发行工作，严把发文质量关，旨在发表图书馆学、情报学、信息管理学及其相关学科的研究文章。《图书馆学研究》杂志是中国图书馆界、图书馆学界创刊较早的刊物之一。
◆ 财务部：
负责图书馆财务管理、进行资金核算， 并对预算执行情况监督和检查。按照财政、主管部门要求，定期编制各类财务报表。根据会计档案归档要求，对单位会计资料进行整理、装订、归档、立卷、保管。进行会计信息系统的维护工作，做好数据备份。配合资产管理部门进行固定资产清查，进行固定资产的价值核算。
◆ 安保部：
负责制定吉林省图书馆消防、治安工作计划及相关规章制度，并组织实施；督促安全防火、治安保卫责任制的落实情况，定期检查落实情况；严密各项管理制度，开展安全教育。定期实施防火检查，定期实施防火检查。负责全馆重点部位的治安防范工作；负责与公安、消防等对口部门的联络，并配合工作。
◆ 办公室：
综合协调全馆各项工作。承担文件、业务档案的管理工作；负责各类公文的录入、统计和报表。负责对外联络与交流、业务统计、各项宣传、馆网维护等工作，组织安排相关会议；负责日常的参观接待、专家研究室和存包处的管理工作；承担总服务台的咨询、办证、电话续借等工作。处理来往信函，及时分发各类信函。
◆物业后勤资产管理中心：
负责设施设备维保、保洁、楼宇内外绿化、辅助功能区的监督管理；水电结算；固定资产的登记、盘点；公务用车管理；报纸信件收发等工作。
◆人力资源部：
制定全馆人力资源发展规划与策略， 制订用工制度、人力资源管理制度、劳动工资制度、人事档案管理制度、员工手册、培训大纲等规章制度、实施细则和人力资源部工作程序，经批准后组织实施，并根据实际情况制订及完善人力资源管理制度、流程、规范，并组织实施与监督人力资源计划。负责综合事务处理，包括员工社会保险与人事关系转移等管理。
◆少儿馆：
负责少儿阅览室、少儿活动室、低幼阅览室服务与管理、“青青草”网站的维护，各项少儿阅读活动的策划与推广，农民工子女阅读基地及学生书房的建设和管理。
